- 20,506
- 46
- 8 Ноя 2022
Новая база данных впервые систематизирует гены, которые NMD «исправляет» или отключает.
Учёные из Кёльна показали, как в человеческих клетках работает «надзор за бессмыслицей» — механизм nonsense-mediated mRNA decay (NMD), отвечающий за контроль качества матричных РНК . Этот процесс следит за «чертежами» белков и удаляет ошибочные молекулы до того, как из них получится укороченный или вредный белок, способный привести к нарушениям развития или раку.
Команда под руководством профессора Нильса Геринга из Института генетики разработала молекулярные переключатели, которые позволяют в строго заданный момент времени отключать ключевой белок NMD — UPF1. Благодаря этому удалось с беспрецедентной точностью проследить, как быстро и в каком порядке NMD воздействует на транскриптом человеческих клеток.
Результаты опубликованы в журнале Molecular Cell в статье «Rapid UPF1 depletion illuminates the temporal dynamics of the NMD-regulated human transcriptome». Одним из главных итогов стала открытая база данных, впервые системно описывающая, какие гены и варианты генов напрямую регулируются NMD. Этот ресурс доступен бесплатно и даёт новые возможности для исследований РНК и генома.
Авторы показали, что NMD подчиняется строгим правилам. Если в «чертежах» белка возникает преждевременный стоп-сигнал, клетка распознаёт ошибку и избавляется от такой мРНК, предотвращая синтез бесполезного или опасного белка . По словам Геринга, новая система впервые позволяет увидеть, насколько быстро и широко действует NMD в человеческих клетках: он не только защищает от ошибок, но и выступает важным регулятором генной активности.
Первый автор работы, доктор Фолькер Бём, отмечает, что с помощью этой методики обнаружено много ранее незамеченных вариантов РНК, в том числе связанных с развитием мозга. Такое разнообразие оказалось неожиданным и, вероятно, объясняется тем, что раньше не было подходящих инструментов для их выявления. По мнению исследователей, созданная база станет важным инструментом для учёных по всему миру.
Соавтор исследования профессор Маркус Ландталер из берлинского Центра Макса Дельбрюка подчёркивает, что этот результат наглядно демонстрирует, как новые технологии позволяют «увидеть» фундаментальные биологические механизмы , имеющие непосредственное значение для здоровья и болезней.
Учёные из Кёльна показали, как в человеческих клетках работает «надзор за бессмыслицей» — механизм nonsense-mediated mRNA decay (NMD), отвечающий за контроль качества матричных РНК . Этот процесс следит за «чертежами» белков и удаляет ошибочные молекулы до того, как из них получится укороченный или вредный белок, способный привести к нарушениям развития или раку.
Команда под руководством профессора Нильса Геринга из Института генетики разработала молекулярные переключатели, которые позволяют в строго заданный момент времени отключать ключевой белок NMD — UPF1. Благодаря этому удалось с беспрецедентной точностью проследить, как быстро и в каком порядке NMD воздействует на транскриптом человеческих клеток.
Результаты опубликованы в журнале Molecular Cell в статье «Rapid UPF1 depletion illuminates the temporal dynamics of the NMD-regulated human transcriptome». Одним из главных итогов стала открытая база данных, впервые системно описывающая, какие гены и варианты генов напрямую регулируются NMD. Этот ресурс доступен бесплатно и даёт новые возможности для исследований РНК и генома.
Авторы показали, что NMD подчиняется строгим правилам. Если в «чертежах» белка возникает преждевременный стоп-сигнал, клетка распознаёт ошибку и избавляется от такой мРНК, предотвращая синтез бесполезного или опасного белка . По словам Геринга, новая система впервые позволяет увидеть, насколько быстро и широко действует NMD в человеческих клетках: он не только защищает от ошибок, но и выступает важным регулятором генной активности.
Первый автор работы, доктор Фолькер Бём, отмечает, что с помощью этой методики обнаружено много ранее незамеченных вариантов РНК, в том числе связанных с развитием мозга. Такое разнообразие оказалось неожиданным и, вероятно, объясняется тем, что раньше не было подходящих инструментов для их выявления. По мнению исследователей, созданная база станет важным инструментом для учёных по всему миру.
Соавтор исследования профессор Маркус Ландталер из берлинского Центра Макса Дельбрюка подчёркивает, что этот результат наглядно демонстрирует, как новые технологии позволяют «увидеть» фундаментальные биологические механизмы , имеющие непосредственное значение для здоровья и болезней.
- Источник новости
- www.securitylab.ru
